צנטריפוגה שולחנית היא צנטריפוגה בעלת קיבולת בינונית המשמשת להפרדה של תערובות הטרוגניות במיליליטר או דגימות. מכשיר זה פועל על ידי סיבוב הדגימות הטעונות בסוגי רוטור שונים במהירות גבוהה. הוא עובר תהליך צנטריפוגה הכולל שימוש בכוח צנטריפוגלי להפרדה של חלקיקים או מקרומולקולות.